Всё, что вы хотели знать о коронавирусе, но боялись спросить

[rex_net]

Введение

Американские ученые, Kristian G. Andersen с коллегами, опубликовали в Nature Medicine следующее расследование:

Вся генетическая информация коронавируса содержится в его РНК. После расшифровки генома, буквы РНК переводят на язык аминокислот, чтобы понять какие белки кодированы в геноме и какова их структура. Ученые расшифровали геном SARS-Cov2 и выложили ее в открытый доступ. Эту информацию о новом коронавирусе сейчас все сравнивают с базами данных о всех других ранее изученных коронавирусах.

На основе этой информации, американские ученые решили выяснить:
- является ли вирус природным или рукотворным
- мог ли он сбежать из лаборатории
- откуда он взялся на наши головы

Ученые обращают внимание на белок S, кодирующем зубцы на поверхности вируса. Именно они придают ему сходство с короной. Как вирус распознает клетку и забирается в нее? Благодаря белку, который кодирован геном S, spike protein. Он находит клетки, и слабые звенья в их оболочке (рецепторы). Потом присоединятся к этим рецепторам, оставляет скафандр снаружи, и заползает в клетку.

Грубо говоря, если белок вируса это ключ, то можно подобрать в какой замок в клетке он подходит. Можно смоделировать как изменится структура протеина в следствие возникновения различных мутаций.

Если помните ранние треды, то мутация в геноме может привести к замене аминокислоты в белке и изменить его структуру, а может и не принести никаких изменений вообще. То есть моделирование помогает нам узнать, насколько эффективным будет ключ, если мутации изменят его внешний вид (отмычка или 100% совпадающие желобки и выемки).

Заражение клетки

Ученые доказали, что белок S в вирусных частицах является ключом к замку рецептора АСЕ2. Рецептор этот архиважен, и встречается он (чаще всего) на поверхности клеток выстилающих легкие (точнее, альвеолы). АСЕ2 играет огромную роль в регуляции сердечной деятельности, задействован также в функции почек, итд. Он также помогает легким бороться с вирусной инфекцией.

С начала эпидемии ученые расшифровали несколько сотен геномов SARS-Cov2. Авторы статьи проанализировали все найденные мутации в гене кодирующем белок S и исследовали то, как они влияют на структуру белка, а значит на то как успешно вирус может инфицировать клетки.

Оказалось, что помимо человека, SARS-Cov2 может заражать летучих мышей (естественно), хорьков, диких кошек, и некоторые другие виды животных. Это мы знали и раньше, так как коронавирусы народ исследует напряжение более 30 лет.

Теперь мы по моделям знаем какие АСЕ2 он атакует (а они у животных различаются). Ключ S, не смотря на все мутации, подходит к АСЕ2 замку человека, но не идеально.

Что из этого следует:
1) наиболее вероятный сценарий, это то, что вирус совсем недавно стал приспосабливаться к распространению в человеке и еще не изменил свой белок S настолько, чтобы подxодить к нему на 100%.
2) Если на секунду допустить что кто-то и пытался создать SARS-Cov2 искусственно, то он был не особенно умен, а то подобрал бы более “правильный” ген для белка S.

Это наводит на мысль, что у SARS-Cov2 природное происхождение.

Другая особенность SARS-Cov2 это хитрый участок в спайке двух частей зубца белка S (для спецов Polybasic Cleavage Site, цель для рестрикции протеазами https://mbio.asm.org/content/8/1/e02298-16. Когда эти две частички зубца отделяются друг от друга...

https://t.co/JuacPLu6En

— Anton Lukashin (@LukashinAnton) March 21, 2020

...то вирус как-бы заряжается для проникновения в клетку.

Спайка между частичками зубцов расщепляется белком по имени фурин, а этот белок в избытке производят наши родные клетки, даже без вирусной инфекции. В старом SARS, расщеплялись они с бóльшим трудом.

Так вот с SARS-Cov2 то же самое. В статье приводятся научные выводы, сделанные на результате осмотра хрущевки (сотен геномов). В нескольких сотнях геномов SARS-Cov2 мы не видим признаков сноса перегородок, а видим всю ту же хрущевку, но со слегка отличающимся интерьером.

От какого животного вирус прыгнул на человека?

На 100% не ясно. SARS-Cov2 на 96% схож с известными штаммами из летучих мышей. Но у него слегка другой белок S. То есть может быть что, перед прыжком на нас, вирус был в другом животном. А может быть что и перешел напрямую, так как нам не известны все штаммы, которые встречаются в летучих мышах.

SARS-Cov2 нашли и в панголинах. Штаммы из них очень похожи и на человеческие, и на летучих мышах, но не по всем мутациям. Зубцы вируса панголинов не так хорошо подходят к нашим АСЕ2. Тот участок в спайке зубцов белка S, ранее видели и в других природных коронавирусах.

Вывод - с полной уверенностью мы пока не можем сказать какое именно животное подарило нам SARS-Cov2.

Источник

Если коротко - американские ученые переплюнули даже английских ученых, о которых ходит столько анекдотов. После длительных исследований они установили, что не знают, откуда взялся новый коронавирус. Это всё, что нужно знать о хваленой американской медицине.

Comments

[vermishel69.livejournal.com]

Да я тебе сделаю научное открытие: в лабораториях ЦРУ вывели это чудо.

[rex-net.livejournal.com]

Если бы в лабораториях ЦРУ вывели, то подобрали бы более “правильный” ген для белка S.

ЦРУ сейчас вообще ничего не может сделать, там и спецов не осталось, одни чиновники, да и тотальный контроль со стороны общества.

[vermishel69.livejournal.com]

Блин, ну, ты такой верующий...

[rex-net.livejournal.com]

Приведи пример успешных операций ЦРУ за последние 10 или 20 лет.

[vermishel69.livejournal.com]

"Успешных" в каком плане? В плане количества уничтоженных людей и масштаба последующих преступлений? Зачем спрашиваешь то, что и сам знаешь. За последние 20 лет - это теракты 11 сентября. Это работа ЦРУ. Только долбоёбы этого не понимают.
И теракт в Бостоне в апреле 2013-го - это тоже была очередная операция ЦРУ.