![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
rex_net
Введение
Американские ученые, Kristian G. Andersen с коллегами, опубликовали в Nature Medicine следующее расследование:
Вся генетическая информация коронавируса содержится в его РНК. После расшифровки генома, буквы РНК переводят на язык аминокислот, чтобы понять какие белки кодированы в геноме и какова их структура. Ученые расшифровали геном SARS-Cov2 и выложили ее в открытый доступ. Эту информацию о новом коронавирусе сейчас все сравнивают с базами данных о всех других ранее изученных коронавирусах.
На основе этой информации, американские ученые решили выяснить:
- является ли вирус природным или рукотворным
- мог ли он сбежать из лаборатории
- откуда он взялся на наши головы
Ученые обращают внимание на белок S, кодирующем зубцы на поверхности вируса. Именно они придают ему сходство с короной. Как вирус распознает клетку и забирается в нее? Благодаря белку, который кодирован геном S, spike protein. Он находит клетки, и слабые звенья в их оболочке (рецепторы). Потом присоединятся к этим рецепторам, оставляет скафандр снаружи, и заползает в клетку.
Грубо говоря, если белок вируса это ключ, то можно подобрать в какой замок в клетке он подходит. Можно смоделировать как изменится структура протеина в следствие возникновения различных мутаций.
Если помните ранние треды, то мутация в геноме может привести к замене аминокислоты в белке и изменить его структуру, а может и не принести никаких изменений вообще. То есть моделирование помогает нам узнать, насколько эффективным будет ключ, если мутации изменят его внешний вид (отмычка или 100% совпадающие желобки и выемки).
Заражение клетки
Ученые доказали, что белок S в вирусных частицах является ключом к замку рецептора АСЕ2. Рецептор этот архиважен, и встречается он (чаще всего) на поверхности клеток выстилающих легкие (точнее, альвеолы). АСЕ2 играет огромную роль в регуляции сердечной деятельности, задействован также в функции почек, итд. Он также помогает легким бороться с вирусной инфекцией.
С начала эпидемии ученые расшифровали несколько сотен геномов SARS-Cov2. Авторы статьи проанализировали все найденные мутации в гене кодирующем белок S и исследовали то, как они влияют на структуру белка, а значит на то как успешно вирус может инфицировать клетки.
Оказалось, что помимо человека, SARS-Cov2 может заражать летучих мышей (естественно), хорьков, диких кошек, и некоторые другие виды животных. Это мы знали и раньше, так как коронавирусы народ исследует напряжение более 30 лет.
Теперь мы по моделям знаем какие АСЕ2 он атакует (а они у животных различаются). Ключ S, не смотря на все мутации, подходит к АСЕ2 замку человека, но не идеально.
Что из этого следует:
1) наиболее вероятный сценарий, это то, что вирус совсем недавно стал приспосабливаться к распространению в человеке и еще не изменил свой белок S настолько, чтобы подxодить к нему на 100%.
2) Если на секунду допустить что кто-то и пытался создать SARS-Cov2 искусственно, то он был не особенно умен, а то подобрал бы более “правильный” ген для белка S.
Это наводит на мысль, что у SARS-Cov2 природное происхождение.
Другая особенность SARS-Cov2 это хитрый участок в спайке двух частей зубца белка S (для спецов Polybasic Cleavage Site, цель для рестрикции протеазами https://mbio.asm.org/content/8/1/e02298-16. Когда эти две частички зубца отделяются друг от друга...
— Anton Lukashin (@LukashinAnton) March 21, 2020
...то вирус как-бы заряжается для проникновения в клетку.
Спайка между частичками зубцов расщепляется белком по имени фурин, а этот белок в избытке производят наши родные клетки, даже без вирусной инфекции. В старом SARS, расщеплялись они с бóльшим трудом.
Так вот с SARS-Cov2 то же самое. В статье приводятся научные выводы, сделанные на результате осмотра хрущевки (сотен геномов). В нескольких сотнях геномов SARS-Cov2 мы не видим признаков сноса перегородок, а видим всю ту же хрущевку, но со слегка отличающимся интерьером.
От какого животного вирус прыгнул на человека?
На 100% не ясно. SARS-Cov2 на 96% схож с известными штаммами из летучих мышей. Но у него слегка другой белок S. То есть может быть что, перед прыжком на нас, вирус был в другом животном. А может быть что и перешел напрямую, так как нам не известны все штаммы, которые встречаются в летучих мышах.
SARS-Cov2 нашли и в панголинах. Штаммы из них очень похожи и на человеческие, и на летучих мышах, но не по всем мутациям. Зубцы вируса панголинов не так хорошо подходят к нашим АСЕ2. Тот участок в спайке зубцов белка S, ранее видели и в других природных коронавирусах.
Вывод - с полной уверенностью мы пока не можем сказать какое именно животное подарило нам SARS-Cov2.
Источник
Если коротко - американские ученые переплюнули даже английских ученых, о которых ходит столько анекдотов. После длительных исследований они установили, что не знают, откуда взялся новый коронавирус. Это всё, что нужно знать о хваленой американской медицине.
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2020-03-21 11:04 am (UTC)Система категоризации Живого Журнала посчитала, что вашу запись можно отнести к категориям: Животные (https://www.livejournal.com/category/zhivotnye?utm_source=frank_comment), Коронавирус (https://www.livejournal.com/category/koronavirus?utm_source=frank_comment), Медицина (https://www.livejournal.com/category/medicina?utm_source=frank_comment), Наука (https://www.livejournal.com/category/nauka?utm_source=frank_comment).
Если вы считаете, что система ошиблась — напишите об этом в ответе на этот комментарий. Ваша обратная связь поможет сделать систему точнее.
Фрэнк,
команда ЖЖ.
no subject
Date: 2020-03-21 11:19 am (UTC)no subject
Date: 2020-03-21 12:26 pm (UTC)no subject
Date: 2020-03-21 12:49 pm (UTC)no subject
Date: 2020-03-21 12:58 pm (UTC)no subject
Date: 2020-03-21 01:15 pm (UTC)В Китае уже не первый раз новые вирусы появляются, по очень простой причине, китайцев много, и живут они скученно, и бытовые привычки у них не очень гигиеничные.
no subject
Date: 2020-03-21 02:15 pm (UTC)Ссылку пришли или пизд@бол.
no subject
Date: 2020-03-21 02:37 pm (UTC)no subject
Date: 2020-03-21 05:25 pm (UTC)Впервые грипп птиц был описан итальянским ветеринаром Эдуардо Перрончито[it] в 1878 под названием куриный тиф. Перрончито сообщал о вспышке высококонтагиозного заболевания, поражающего кур на фермах в окрестностях Турина (Италия).
Некоторое время грипп птиц путали с болезнью Ньюкасла, но после установления этиологии последнюю стали называть псевдочумой или азиатской чумой птиц, а грипп птиц — классической или европейской чумой птиц.
Вспышки европейской чумы птиц регулярно происходили в начале XX века в странах Европы, Африки и Азии. В 1925 болезнь попала в Северную Америку. Во второй половине XX века только за рубежом зарегистрировано 18 крупных эпизоотий.
В 1901 была установлена вирусная природа возбудителя, но только в 1955 было доказано, что вирус, вызывающий «птичью чуму», является вирусом гриппа.
Современное название — грипп птиц — данное заболевание получило лишь в 1971. Применительно к наиболее опасным формам (например, вызванным штаммом H5N1) употребляется также термин высокопатогенный грипп птиц.
https://ru.wikipedia.org/wiki/Птичий_грипп
no subject
Date: 2020-03-21 12:30 pm (UTC)Да я тебе сделаю научное открытие: в лабораториях ЦРУ вывели это чудо.
no subject
Date: 2020-03-21 12:33 pm (UTC)ЦРУ сейчас вообще ничего не может сделать, там и спецов не осталось, одни чиновники, да и тотальный контроль со стороны общества.
no subject
Date: 2020-03-21 01:23 pm (UTC)Блин, ну, ты такой верующий...
no subject
Date: 2020-03-21 02:16 pm (UTC)no subject
Date: 2020-03-23 06:47 am (UTC)И теракт в Бостоне в апреле 2013-го - это тоже была очередная операция ЦРУ.